Kanserlerin Karmaşıklıkları, Kapsamlı Genomik Analizde Detaylı Ortaklıklar

A massive undertaking involving more than 1,300 scientists from 37 countries reported in 23 papers shows the results of analyzing 47 million genetic changes in 2,600 genomes of 38 different tumor types. 23 makalede bildirilen 37 ülkeden 1.300'den fazla bilim insanının katıldığı büyük bir girişim, 38 farklı tümör tipinin 2,600 genomunda 47 milyon genetik değişikliğin analizinin sonuçlarını göstermektedir. The Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) presented what the researchers called “the most comprehensive study of whole cancer genomes to date.” Tüm Genomların Pan-Kanser Analizi (PCAWG) araştırmacıların “bugüne kadar tüm kanser genomlarının en kapsamlı çalışması” dediklerini sundu.
En son sıralama ve hesaplamalı bilişim teknolojilerinden yararlanan araştırmacılar, 16 çalışma grubuna ayrıldı, kanserdeki genetik karmaşıklıklara ve ortak noktalara kapı açtı ve daha fazla keşif ve nihai tedaviye neden olabilecek içgörüler sundular.
PCAWG analyzed whole genomes rather than the more common approach of sequencing only protein-coding regions. PCAWG, sadece protein kodlayan bölgelerin dizilimine yönelik daha yaygın bir yaklaşımdan ziyade tüm genomları analiz etti. They produced 1,188 tumor transcriptomes to link RNA and DNA alterations and explored genetic drivers, tumor signatures, and virus DNA found in cancers. RNA ve DNA değişikliklerini bağlamak için 1.188 tümör transkriptomu ürettiler ve kanserlerde bulunan genetik sürücüleri, tümör imzalarını ve virüs DNA'sını araştırdılar. These analyses generated more than 800 terabytes of data, roughly equivalent to the storage required for 200,000 movies. Bu analizler 800 terabayttan fazla veri üretti ve kabaca 200.000 film için gereken depolamaya eşitti.
PCAWG found cancer-driver mutations for 95% of cases, and that on average each cancer genome has four or five drivers. PCAWG, vakaların% 95'inde kanser sürücüsü mutasyonları buldu ve ortalama olarak her kanser genomunun dört veya beş sürücüsüne sahip olduğunu. Sizable minorities of cancers showed signs of chromoplexy (17.8%) or chromothripsis (22.3%), reflecting complex and chaotic rearrangement processes. Kanserlerin büyük azınlıkları, karmaşık ve kaotik yeniden düzenleme süreçlerini yansıtan kromopleksi (% 17.8) veya kromotripsis (% 22.3) belirtileri gösterdi. The researchers found that genetic changes leading to cancer occur early on—sometimes decades in advance of diagnosis. Araştırmacılar, kansere yol açan genetik değişikliklerin erken teşhis edildiğini - bazen on yıllarca tanıdan önce olduğunu buldular.
The investigation also uncovered genetic drivers in noncoding DNA, like noncoding regions of the tumor-suppressor gene TP53 and of the telomerase gene TERT. Araştırma ayrıca tümör baskılayıcı gen TP53'ün ve telomeraz geni TERT'nin kodlayıcı olmayan bölgeleri gibi kodlayıcı olmayan DNA'daki genetik sürücüleri ortaya çıkardı. Another PCAWG team characterized mutational signatures using more than 84 million somatic mutations from 4,645 whole-genome and 19,184 exome sequences to describe 81 signatures including single- doublet- and clustered-base-substitutions as well as small insertion-and-deletion signatures, many not previously identified. Başka bir PCAWG ekibi, 4,645 tüm genom ve 19,184 ekzom sekansından 84 milyondan fazla somatik mutasyon kullanan mutasyon imzalarını karakterize etti, bunların çoğu tek-çiftli ve kümelenmiş baz ikamelerinin yanı sıra küçük ekleme ve silme imzalarını içeren 81 imzayı tanımladı önceden tanımlanmış. In a first, another team identified 16 structural variants involving large rearrangements. Birincisi, başka bir ekip büyük yeniden düzenlemeleri içeren 16 yapısal varyant belirledi.
Kanserle ilişkili virüslerin analizi, Epstein-Barr virüsü, hepatit B virüsü ve insan papillomavirüsünün yaygınlığını vurguladı.
All the PCAWG papers, published in Nature and related journals, are open access at nature.com/collections/afdejfafdb. Nature ve ilgili dergilerde yayınlanan tüm PCAWG makaleleri nature.com/collections/afdejfafdb adresinden açık erişime sahiptir. The researchers' raw genome sequencing data and other resources also are available to researchers. Araştırmacıların ham genom dizileme verileri ve diğer kaynakları da araştırmacılar tarafından kullanılabilir.
ÇOCUK, ERGENLERDE ÇALIŞAN OPIOİD ZEHİRLENMELERİ
About one-quarter of opioid poisonings occur in children and adolescents, and poisoning incidents have become more severe in recent years, according to an abstract presented at the Society of Critical Care Medicine's annual congress. Çocuk ve ergenlerde opioid zehirlenmelerinin yaklaşık dörtte biri meydana gelir ve Kritik Bakım Tıbbı yıllık kongresinde sunulan bir bildiriye göre, zehirlenme olayları son yıllarda daha şiddetli hale gelmiştir. The retrospective study of more than 750,000 opioid poisoning cases reported to the National Poison Data System from 2005 to 2018 found that 27.5% (207,543) of cases occurred in patients younger than age 19. 2005'ten 2018'e kadar Ulusal Zehir Veri Sistemine bildirilen 750.000'den fazla opioid zehirlenmesi vakasının retrospektif çalışması, vakaların% 27.5'inin (207.543) 19 yaşından küçük hastalarda meydana geldiğini bulmuştur.
Trend analysis over three eras (2005–2009, 2010–2014, and 2015–2018) showed that the percentage of patients admitted to critical care units and deaths increased over time; Üç dönem boyunca eğilim analizi (2005–2009, 2010-2014 ve 2015-2018), kritik bakım ünitelerine ve ölümlere başvuran hastaların yüzdesinin zamanla arttığını göstermiştir; 6.6%, 8.5%, and 9.6% and 0.18%, 0.20%, and 0.28%, respectively. Sırasıyla% 6.6,% 8.5 ve% 9.6 ve% 0.18,% 0.20 ve% 0.28'dir. The probability of having a moderate or major effect also rose, by 0.55% and 0.11%, respectively. Orta veya büyük bir etkiye sahip olma olasılığı da sırasıyla% 0.55 ve% 0.11 arttı.
İntihar etme niyeti olan opioid zehirlenmeleri üç zaman diliminde% 13.9'dan% 21.2'ye yükselmiştir.
Yayınlanan ayrı bir raporda, araştırmacılar, 4 yaşından küçük çocuklarda ve 15 ila neredeyse 19 yaş arasındaki gençlerde, opioid zehirlenmeleri için iki pik yaş dağılımı gözlemlediklerini söyledi.
ŞÜPHELİ AKCİĞER EMBOLİZMASI ÜZERİNDEKİ ACİL DURUM DEPARTMANLARI
Bilgisayarlı tomografik pulmoner anjiyografi (CTPA), pulmoner emboli (PE) tanısal çalışmasında aşırı kullanıldı ve yazarlara göre D-dimer testini içeren protokollerin düşük verim CTPA taramasını azaltmak için acil ihtiyaç ve uygulanmasının altını çizdi. PE ile ilgili testleri içeren acil servis (ED) uygulamalarını inceleyen bir çalışmanın (Circ Cardiovasc Qual Sonuçlar 2020; 13: e005753).
The study, a cross-sectional analysis of electronic health record and billing data from 16 EDs in Indiana and 11 hospitals in the Dallas-Fort Worth area, identified ED patients who underwent any of the following, including D-dimer testing, CTPA, scintillation ventilation perfusion lung scanning, or pulmonary angiography. Indiana'daki 16 ED ve Dallas-Fort Worth bölgesindeki 11 hastaneden alınan elektronik sağlık kaydı ve faturalandırma verilerinin kesitsel bir analizi olan çalışma, D-dimer testi, CTPA, sintilasyon dahil olmak üzere aşağıdakilerden herhangi birini yapan ED hastalarını belirledi. ventilasyon perfüzyon akciğer taraması veya pulmoner anjiyografi. Out of 1.83 million patient encounters, 5.3% had a diagnostic test for PE. 1,83 milyon hasta ile karşılaşılan hastaların% 5,3'ünde PE tanısı kondu. Nearly 60% of all patients who had tests for PE underwent CTPA without D-dimer testing. PE testi olan hastaların yaklaşık% 60'ına D-dimer testi yapılmadan CTPA uygulandı. About 21% of CTPA took place in women younger than age 45, who are at greater risk of cancer from CTPA radiation exposure, according to the authors. Yazarlara göre CTPA'nın yaklaşık% 21'i, CTPA radyasyonuna maruz kalma nedeniyle daha fazla kanser riski altında olan 45 yaşından küçük kadınlarda meydana geldi.
PE için CTPA'nın tanısal verimi% 3.1, Indiana ED'lerde% 1.3 ve Dallas-Fort Worth tesislerinde% 4.8 idi.
Indiana'daki hastaların Dallas-Fort Worth'daki hastalardan CTPA'dan önce D-dimer testi alma olasılıkları daha düşüktü (sırasıyla% 52'ye karşılık% 30) ve muhtemelen Dallas-Fort Worth'da gerçekleşen hedeflenmiş bir kalite geliştirme girişiminin etkisini yansıtmaktadır düşük riskli hastalarda D-dimer testi kullanımını arttırmak.
The data imply that “D-dimer ordering correlates with an increased yield rate of PE on CTPA,” wrote the investigators. Araştırmacılar, “D-dimer sıralamasının CTPA üzerindeki PE veriminin artmasıyla ilişkili olduğunu” ortaya koyuyor. “This relationship suggests but does not prove a positive cause-effect relationship between rate of D-dimer ordering and PE yield.” “Bu ilişki, D-dimer sıralaması oranı ile PE verimi arasında pozitif bir neden-sonuç ilişkisi olduğunu düşündürüyor ancak kanıtlamıyor.”